壓力噴霧干燥機的壓力式干燥是物料通過高壓泵增加，物料經過耐磨損的噴嘴后高壓霧化，霧化角度一般在60-80°之間。物料和熱風分配器并流進行干燥，霧滴在干燥時由于比較集中，在強度高的蒸發時易產生中空的顆粒，物料復溶時容易。同時可以進行二次附聚設計，自旋風分離器下來的物料可以進行附聚再造粒，細粉與霧滴進行二次造粒，形成的顆粒度比較大，做膠原蛋白粉時目數一般在120目左右。

離心噴霧造粒干燥機離心式干燥主要是物料通過高速旋轉的離心分配盤產生的離心力將物料分配成霧滴狀，與通過蝸殼熱風分配器的熱風相接觸后瞬間干燥。由于是將物料高速旋轉進行離心分配，物料分度的直徑比較大，需要較大的直徑，如果直徑小的話，霧滴直接接觸到塔壁會黏壁，掛粉。故離心干燥機一般設計的直徑都相對較大。

同時由于物料是被離心力甩出來，霧滴的相對大小比較均勻，霧滴與熱風接觸的被干燥，霧滴干燥成基本都是實心球體，物料的顆粒度比較均勻，但是相對復溶性相對較差，物料的顆粒度相對較小，做膠原蛋白粉時一般目數在200目左右。

相比而言，壓力噴霧干燥機既可以并流型進風、逆流型進風，也可以混流型進風；般生產膠原蛋白為并流型進風；既可以底部排風也可以頂部排風，頂部上排風相對熱能利用率高，更加節能。而離心式噴霧干燥只能是并流型進風；一般都是底部排風，熱能利用率低。

除此之外，這兩種干燥機的后期維護費用也有區別。離心式噴霧干燥機組后期離心分配器的維護成本比較高；壓力噴霧干燥機的后期維護費用更換噴片，維護費用低。